Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppfibp2O35711 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms