Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx8O35652 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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