Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms