Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms