Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Prrt1O35449 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prrt1O35449 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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