Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kpna3O35344 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms