Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf5O35326 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf5O35326 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms