Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Smad6O35182 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Smad6O35182 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smad6O35182 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms