Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gfra3O35118 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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