Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Kcnk3O35111 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcnk3O35111 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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