Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha8O09127 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epha8O09127 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Epha8O09127 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Epha8O09127 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha8O09127 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha8O09127 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms