Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sypl1O09117 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms