Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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