Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra2O08842 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms