Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Barx2O08686 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Barx2O08686 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms