Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3aO08665 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3aO08665 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms