Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AlyrefO08583 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms