Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22bO08547 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms