Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccer2J3QPU5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccer2J3QPU5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms