Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spin2fJ3QPU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms