Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm19965J3QNY8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm19965J3QNY8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms