Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21797J3QNW5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21797J3QNW5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms