Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gm10428J3QNV7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm10428J3QNV7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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