Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm17577J3QNF7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17577J3QNF7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17577J3QNF7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm17577J3QNF7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17577J3QNF7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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