Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700014D04RikJ3QMS2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms