Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3727J3QM54 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3727J3QM54 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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