Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm21818J3KMS6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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