Protein–RNA interactions for Protein: J3KMM7

A630095N17Rik, RIKEN cDNA A630095N17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630095N17RikJ3KMM7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms