Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20828J3KMI7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms