Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pot1bH7BX60 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms