Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29394H3BIW7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms