Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn20G5E8X0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn20G5E8X0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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