Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trip12G5E870 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms