Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SprtnG3X912 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SprtnG3X912 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SprtnG3X912 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SprtnG3X912 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SprtnG3X912 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SprtnG3X912 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SprtnG3X912 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SprtnG3X912 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SprtnG3X912 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms