Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim55G3X8Y1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms