Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd5G3UW60 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms