Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp32F8VPZ3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp32F8VPZ3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp32F8VPZ3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms