Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3371F7CQW8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3371F7CQW8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms