Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm20538F6Z9R1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms