Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms