Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm21876F6XK35 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21876F6XK35 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms