Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm42421F6X8D5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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