Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SmgcF6VRN1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SmgcF6VRN1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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