Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syngap1F6SEU4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syngap1F6SEU4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms