Protein–RNA interactions for Protein: E9QAI8

Gm3460, Predicted gene 3460, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3460E9QAI8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3460E9QAI8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms