Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TrdnE9Q9K5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms