Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FancfE9Q5Z5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FancfE9Q5Z5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms