Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pgbd1E9Q492 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms