Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm3020E9Q3J7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm3020E9Q3J7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3020E9Q3J7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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