Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrp3E9Q1T6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrp3E9Q1T6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms